结石由人体代谢产物构成，因此与新陈代谢有密切的关系。例如含钙结石就和钙磷代谢、草酸代谢有关。不同种类的结石，代谢异常的原因不同。

　　常见的有痛风、高尿酸血症、甲状旁腺功能亢进、肾小管性酸中毒、吸收型高草酸尿(小肠切除、内源性疾病、空肠回肠旁路术等使结肠粘膜上皮直接暴露于胆盐，使结肠对草酸吸收大大增加所致)等